Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms