Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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