Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5640A3KG49 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms