Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms