Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms