Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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