Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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Tubb1A2AQ07 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Tubb1A2AQ07 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Tubb1A2AQ07 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Tubb1A2AQ07 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Tubb1A2AQ07 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Tubb1A2AQ07 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Tubb1A2AQ07 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Tubb1A2AQ07 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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