Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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