Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms