Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms