Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms