Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms