Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms