Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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