Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms