Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms