Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms