Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Shcbp1Q9Z179 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Shcbp1Q9Z179 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Shcbp1Q9Z179 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Shcbp1Q9Z179 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Shcbp1Q9Z179 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Shcbp1Q9Z179 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Shcbp1Q9Z179 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Shcbp1Q9Z179 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shcbp1Q9Z179 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Shcbp1Q9Z179 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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