Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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Cldn9Q9Z0S7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Cldn9Q9Z0S7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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