Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Cldn13Q9Z0S4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Cldn13Q9Z0S4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Cldn13Q9Z0S4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Cldn13Q9Z0S4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Cldn13Q9Z0S4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Cldn13Q9Z0S4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Cldn13Q9Z0S4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Cldn13Q9Z0S4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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