Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ArcQ9WV31 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ArcQ9WV31 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ArcQ9WV31 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ArcQ9WV31 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms