Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV18

Gabbr1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabbr1Q9WV18 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gabbr1Q9WV18 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gabbr1Q9WV18 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gabbr1Q9WV18 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabbr1Q9WV18 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabbr1Q9WV18 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabbr1Q9WV18 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gabbr1Q9WV18 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gabbr1Q9WV18 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gabbr1Q9WV18 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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