Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stub1Q9WUD1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms