Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms