Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clcf1Q9QZM3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms