Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms