Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VapbQ9QY76 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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