Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp1Q9QY53 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nphp1Q9QY53 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms