Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Snai3Q9QY31 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms