Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Limd1Q9QXD8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms