Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.2 ms