Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms