Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PolkQ9QUG2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PolkQ9QUG2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PolkQ9QUG2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PolkQ9QUG2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PolkQ9QUG2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PolkQ9QUG2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PolkQ9QUG2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PolkQ9QUG2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PolkQ9QUG2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PolkQ9QUG2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PolkQ9QUG2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PolkQ9QUG2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PolkQ9QUG2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PolkQ9QUG2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PolkQ9QUG2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms