Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Prg4Q9JM99 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Prg4Q9JM99 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Prg4Q9JM99 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Prg4Q9JM99 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Prg4Q9JM99 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Prg4Q9JM99 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Prg4Q9JM99 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Prg4Q9JM99 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms