Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rabgef1Q9JM13 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rabgef1Q9JM13 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rabgef1Q9JM13 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rabgef1Q9JM13 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rabgef1Q9JM13 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rabgef1Q9JM13 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rabgef1Q9JM13 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rabgef1Q9JM13 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rabgef1Q9JM13 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rabgef1Q9JM13 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rabgef1Q9JM13 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rabgef1Q9JM13 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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