Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Tmod4Q9JLH8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Tmod4Q9JLH8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Tmod4Q9JLH8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Tmod4Q9JLH8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Tmod4Q9JLH8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Tmod4Q9JLH8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Tmod4Q9JLH8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod4Q9JLH8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms