Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms