Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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CubnQ9JLB4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
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CubnQ9JLB4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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CubnQ9JLB4 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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CubnQ9JLB4 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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CubnQ9JLB4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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CubnQ9JLB4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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CubnQ9JLB4 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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CubnQ9JLB4 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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CubnQ9JLB4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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CubnQ9JLB4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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CubnQ9JLB4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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CubnQ9JLB4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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CubnQ9JLB4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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CubnQ9JLB4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms