Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL19

Ncoa6, Nuclear receptor coactivator 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,067 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ncoa6Q9JL19 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ncoa6Q9JL19 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ncoa6Q9JL19 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ncoa6Q9JL19 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ncoa6Q9JL19 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ncoa6Q9JL19 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ncoa6Q9JL19 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ncoa6Q9JL19 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ncoa6Q9JL19 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ncoa6Q9JL19 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ncoa6Q9JL19 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ncoa6Q9JL19 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ncoa6Q9JL19 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ncoa6Q9JL19 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ncoa6Q9JL19 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ncoa6Q9JL19 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ncoa6Q9JL19 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Ncoa6Q9JL19 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ncoa6Q9JL19 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Ncoa6Q9JL19 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Ncoa6Q9JL19 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Ncoa6Q9JL19 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Ncoa6Q9JL19 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Ncoa6Q9JL19 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Ncoa6Q9JL19 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Ncoa6Q9JL19 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Ncoa6Q9JL19 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Ncoa6Q9JL19 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Ncoa6Q9JL19 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncoa6Q9JL19 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms