Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms