Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Tuba8Q9JJZ2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Tuba8Q9JJZ2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Tuba8Q9JJZ2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Tuba8Q9JJZ2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Tuba8Q9JJZ2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Tuba8Q9JJZ2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Tuba8Q9JJZ2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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