Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHB3

Timp4, Metalloproteinase inhibitor 4, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp4Q9JHB3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Timp4Q9JHB3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Timp4Q9JHB3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Timp4Q9JHB3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Timp4Q9JHB3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Timp4Q9JHB3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Timp4Q9JHB3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Timp4Q9JHB3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Timp4Q9JHB3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Timp4Q9JHB3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Timp4Q9JHB3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Timp4Q9JHB3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Timp4Q9JHB3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Timp4Q9JHB3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Timp4Q9JHB3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Timp4Q9JHB3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Timp4Q9JHB3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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