Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms