Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim54Q9ERP3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Trim54Q9ERP3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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