Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms