Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms