Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gtf3c6Q9D8P7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gtf3c6Q9D8P7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gtf3c6Q9D8P7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gtf3c6Q9D8P7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gtf3c6Q9D8P7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gtf3c6Q9D8P7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gtf3c6Q9D8P7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gtf3c6Q9D8P7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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