Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl4Q9D8E6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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