Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms