Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms